Dưới chân núi là một hồ nước rộng, phong cảnh nên thơ. Từ sân chùa núi Châu Thới có thể ngắm nhìn phong cảnh của các vùng xung quanh thành phố Biên Hòa cùng dòng sông Đồng Nai uốn quanh.
Kiến trúc chùa chính gồm một quần thể bao gồm: ngôi chánh điện, nhà Tổ, điện Thiên Thủ Thiên Nhãn, miếu thờ Linh Sơn Thánh Mẫu, điện thờ Diêu Trì Kim Mẫu và Ngũ Hành Nương Nương (thuộc tín ngưỡng dân gian) và cả điện thờ Ngọc Hoàng Thượng Đế. Cấu trúc mái trên chánh điện theo kiểu tứ tượng. Chùa Châu Thới có lối kiến trúc cổ xưa với tông màu vàng hút mắt. Chùa sử dụng những mảnh gốm sứ đắp lên các con rồng ở cuối các đầu đao của mái chùa. Trên đỉnh mái, có chín con rồng nhìn ra nhiều hướng. Mặt tiền được đắp gốm sứ tạo các loại hình như tứ linh, thủ quyển, đức Phật đản sanh… Bao quanh ngôi chùa có rất nhiều hồ nước nhân tạo, cây cỏ và núi đá tạo thành một cảnh quanh vừa hoang sơ lại thơ mộng khó tả.
Mặc dù ngôi chùa được trùng tu nhiều lần nhưng vẫn giữ được kiến trúc cổ kính của nó, hài hòa với cảnh quan u nhã, thoát phàm tại đây. Đến đây, quý khách sẽ được tận hưởng bầu không khí trong lành, tiếng chim hót véo von, tiếng gió thổi nhè nhẹ cộng với tiếng chuông chùa ngân vang, bạn sẽ cảm thấy tâm tịnh, tinh thần thoải mái như trút bỏ mọi lo âu buồn phiền của cuộc sống hàng ngày.